Le père de Tadashi Daiba est tué par les fantômes de ses anciens compagnons. Harlock vient alors pour respecter la promesse qu'il lui avait fait et emmène Tadashi dans son vaisseau, l'Arcadia, pour faire de lui un homme. Après avoir récupéré le reste de son équipage, il devra à nouveau lutter contre la force mystérieuse qui s'est emparé du corps des anciens compagnons du docteur Daiba, tout en affrontant le commandant des forces terriennes qui a juré d'attraper le pirate.

Comme il est dit en avant-propos, cette série revisite la toute première réalisée à la fin des années 70. On y retrouve donc le même réalisateur, Rintaro, personnage bien connu de l'animation Japonaise, mais la série bénéficie cette fois-ci des dernières technologies dans le domaine de l'animation. L'ambiance est quand à elle différente, car si la première série se voulait épique, montrant Harlock affrontant les Sylvidres pour défendre la Terre et combattant Vilack qui tente de le piéger en se servant de Stellie, là, notre héros affronte un démon venu du confin de l'Univers qui ne rêve que de Chaos. L'espoir est mince dans cette série, si ce n'était pour l'équipage de l'Arcadia et son idéal de liberté. Mais c'est un leitmotiv chez Matsumoto, une petite lueur d'espoir qui apparaît quand tout semble au plus mal.
Ici, l'ambiance est quasiment lugubre donc, techniquement, les couleurs sont sombres, et les musiques signées Takayuki Hattori flirtent avec l'angoissant (les musiques caractérisant l'ennemi) et le mélancolique (comme le magnifique générique de fin sous fond de blues) et donnent de suite le ton. N'oublions pas le design plus que classe de Nobuteru Yuuki qui rende le pirate plus beau que jamais tout en respectant particulièrement le design original de Matsumoto. Notez aussi que le rendu des personnages féminins et plus qu'agréable, ne serait-ce que Yuki Hotaru, plus connue chez nous sous le nom de Nausicaa.

Bien entendu, la série n'est pas non plus uniquement une série d'horreur, et elle sait avoir ses moments de bravoures, où l'on voit notre héros dans toute sa superbe terrassant les méchants par les pouvoirs de sa volonté (ou de son vaisseau, l'Arcadia, plus beau que jamais).

La série est courte, puisqu'en 13 OAV, ce qui permet au scénario de ne pas se perdre, sans pour autant être trop compressé. Chaque personnage connaît son heure de gloire, même les méchants, ceci donnant une certaine cohérence à l'ensemble.

La série ne saura peut-être pas plaire à tout le monde, sans doute son ambiance trop différente, mais si l'on rentre dedans, le staff brilliant à la réalisation et la mise en scène fantastique donnent véritablement envie de connaître le fin mot de l'histoire.